Showing posts with label theory. Show all posts
Showing posts with label theory. Show all posts

Monday, February 6, 2012

Different DNA

"Most eukaryotic chromosomes include packaging proteins which, aided by chaperone proteins, bind to and condense the DNA molecule to prevent it from becoming an unmanageable tangle."

However there is a phase in cellular mitosis (division) when, before replication, chromosomes need to be unpackaged.

How do they manage to remain a "manageable tangle" during that period?

BTW there is another thing i don't understand in this video that shows a strand already unpackaged being processed by the enzymes helicase/polymerase to create two strands. Where it comes from the "material" added by the polymerase to create the second strand?

Can a packed chromosome perform the same function like transmitting information to ribosomes on how to build protein as an unpacked one? How fragment copies of DNA pass that "scaffolding" (image below)?

According to current theories, human chromosomes' "double stranded helicoidal DNA" range in length from 51 million to 245 million base pairs of atoms. At actual size, an average human cell chromosome totals up to 3 meters long and a few angstroms (10 to minus 10 meters) wide, made of two very long strings (strands) of atoms linked together as pairs. The longest known molecule.

To replicate, each double helix has to unwind and separate in two strands and and each strand of course has to stay in one piece. Each strand then acts as a template for a new strand or its new pair that needs to be packed back together. But at least at a certain moment when it is unpacked, it should be indeed an "unimaginable tangle".

And who or what is doing the job of unpacking/packing, scaffolding, etc..?

If you take a look at the picture below you'll see the 5 levels of winding or packaging of the DNA. At least at three different levels the DNA is packed with different types of "fiber".

Chromosomes are visible under microscope. Here is a video showing the very moment of the separation of the chromosomes during the mitosis (dividing) of one cell.

However no unpacking, unwinding/rewinding etc. of the double helix strands is apparent. They appear to separate like they were in the final stage from the picture above. According to the current theory the video basically shows each chromosome as a clew separating into two without any unwinding.

This video (animation) catches and earlier phase, "condensation" but still no replication. Condensation appears to be the last level of packaging as in the image above.

Thursday, February 2, 2012

Başçavuş

În răspuns la http://hydepark.ro/articol/articol/despre-cultul-lui-ceausescu-elefantiazisul-servilismului-507.html

Nu pot să scriu asta ca un comentariu în acel Hyde Park românesc (http://hydepark.ro/) că nu ştim cine/dacă ne aude sau ne citeşte. Şi s-ar putea să iasă chiar mai lung decât un comentariu.

Deci să trecem la treburi serioase, dimineaţa, cu mintea limpede şi anima goală, dacă ne ajută glicemia şi mai lasă vecinii(le) uşile din trântit. Ok, cea cu Mercedesul a plecat, în scârţâit de curea de alternator. Mai e Jeepul şi după aia e linişte.

Mi-am notat în vocabular cuvintele neştiute din articol, din care unul îmi stăruie în memorie. Din alea care îţi pun de obicei piedică în elanul gândirii într-un text. Ubicuu. L-am auzit şi pe la noi. Gata, pe ăsta îl caut în dicţionar. Un alt cuvânt pentru omniprezent. O fi vreo nuanţă acolo dar nu avem timp.

Începusem ieri să scriu într-un comentariu. M-am gândit la chestia asta mai demult. Cândva, în şcoala generală, ne-au învăţat despre inducţia matematică. La şiruri. Deci pui o ipoteză şi o verifici pe următorul termen. Cred că pentru oameni disperaţi, care nu mai au altă şansă, se poate încerca şi la istorie.

Când nu mai putem descâlci ce au făcut înaintaşii noştri, nu de alta, dar ca să nu o repetăm, vorba înţeleptului. Ca să ieşim din ciclu. Când nu vrea să ne spună nimeni nimic.

A şi să nu uit. Apropo de cuvinte. Ele pot să ne spună multe despre trecut. Din etimologia unui cuvânt (nu) poţi rupe istoria formării lui. Într-o zi când nu aveam ceva mai bun de făcut m-am uitat prin dicţionare. Acu este google translate şi ne ajută el. Oare nimeni, chiar nimeni nu a avut nimic de spus până acum despre etimologia numelui fostului omniprezent? Atât de omniprezent că ni s-au saturat creierele la toţi, numele lui devenise un cuvânt comun care a săpat cărări adânci prin creţii creierilor noştri şi aşa aburiţi şi nu s-a mai gândit nimeni la ciudăţenie. Dar cei din lumea liberă nu s-au gândit?

Ia să scoatem şi spell check-ul automat că se blochează cursorul. Gata.

çavuş http://translate.google.com/#tr|ro|%C3%A7avu%C5%9F = sergent, se pronunţă ceauş pentru cei ce nu vor să clicăie

nu ne putem abţine aici să aducem în atenţie şi alte câteva cuvinte turceşti dacă tot eram la google translate

başçavuş http://translate.google.com/#tr|en|ba%C5%9F%C3%A7avu%C5%9F = sergent major

Yüzbaşı http://translate.google.com/#tr|ro|y%C3%BCzba%C5%9F%C4%B1 = căpitan

manì. http://dexonline.ro/definitie/manea (ăsta nu era în google translate dar ne bazăm puţin acu şi pe http://dexonline.ro.

şi e o listă întreagă de grade din armata turcă care au ca rădăcină cuvântul çavuş, iar baş (LOL) înseamnă ceva ca şef in turcă! (Unde întoarcem capul dăm iar peste politică, nu se poate fără ea)

Gata nu vă speriaţi nu vreau să învăţăm aici împreună limba turcă ca Iorga de la Bucureşti la Giurgiu. Dar cred că v-aţi făcut o idee de ce vreau să spun. O listă mai lungă, de vreo 400 de cuvinte, o voi pune într-o postare separată, chiar uitasem, o am undeva, după un query pe site-ul http://dexonline.ro. Da, @400 de cuvinte din fondul lexical de bază românesc provine din turcă, cam cât din slavă etc.

Cu toate că numele mic al ubicuului a fost Nicolae, care e grecesc, chiar foarte comun în Grecia LOL de câte ori aud numele ăsta îmi aduc aminte de replica din film: ”Taki, Sophie, Kari, Nick, Nick, Nick, Nick, Nick, Nick, Nick, uh, Nikki, and I am Gus” Hă hă hă hă hă https://www.youtube.com/watch?v=_dyujnqFuBo iar numele lui ta-su a fost Andruţă, clar grec, da să nu uităm că şi grecii au fost sub turci, chiar puţin mai mult şi mai aproape decât noi.

Deci aplicând metoda inductivă cu aceste nume în gând şi gândindu-ne că Imperiul Otoman se mai chema şi Sublima Poartă, mai gândindu-ne că poate aceste nume chiar sunt nişte simboluri subliminale similare cu cele folosite de masonerie, dar întoarse pe dos, către vechiul răsărit, hai să construim ipoteza.

Comunismul în România la început a fost clar, ocupaţie, dar după aia, de ce nu, reciclat de locali şi folosit pe post de limbă de ceas pe care o întorci înapoi cu vreun secol şi încerci să restaurezi vechea ordine atât de înrădăcinată pe tulpina culturii româneşti, facând asta sub perdeaua prăfuită a dictaturii, după marea curăţenie făcută deja de sovietici.

Oare aşa o fi fost şi la ruşi, cu Stalin după Lenin?

Postarea domnului sus linkat m-a luat înainte, aveam două postări de scris despre chestia asta, una despre influenţa limbii turce în limba română şi alta despre originea comunismului. Asta sunt eu, nu mă pot abţine, bunicul meu îmi reproşa mereu că sunt nerăbdător. Dar am răbdat destul...

Şi oricum, articole/postări despre originea comunismului se scriu tot timpul în România, de 20 ani.

Deci uitându-ne la articol, (apropo, ”sursa puterii" nu era monolitul de partid ci armata de ocupaţie şi după aia securitatea). Conform ipotezei mele, ”moştenirea leninistă” normal, nu mai trebuia căci oricum nu mai vroiau ei să facă comunismul ci alte chestii totalitare. Normal că cei din lista deviaţioniştilor au fost eliminaţi fiindcă ei poate au fost comunişti (nu vreau să dezbat prea mult, toată lumea ştie că comunismul e o fomă de masonism). Dar cel mai bine verifică ipoteza mea fraza ”Ritualuri bizantine de glorificare erau astfel contopite cu pretenţii de ortodoxie marxist-leninista”. QED, nici nu mai merg mai departe.

Pentru cei cărora ce am scris mai sus le va suna a politică, am mai scris aceleaşi chestii cu ani în urmă, poate nu sintetizate astfel, în multe emailuri pe la prieteni.

Tuesday, January 17, 2012

Why Chiropractic Works

For a better view, please click on the pictures then on the small icons below.


This idea came to me motivated by the dreadfull popping sound of my vertebrae during my first and only manipulation.

The chiropractor popped his fingers before the procedure right in front of me, "preparing me" for what was to come; the sound of maybe ten of my vertabrae popping like popcorn in the oven while he pressed once, shortly and decisively with both palms of his hands crossed on my spine! He explained me that the sound i will hear during the adjustment comes from the CO2 instantly boiling in the disk due to low pressure in a similar way the sinovial fluid would if you extended the articulation of you fingers and make them pop, due to the relative vacuum being created in the articulation (sinovial fluid). Obviously, he lost too many clients after the first visit that made it worthy to pop his fingers. As i was skeptic, he did it with several fingers until i started feeling for him.

I was never able to pop my fingers :( , but ever since i tried to figure how you can create vacuum in the disk by simply pressing perpendicularly on the axis of one's spine.

What's happening is the disks are being deformed as following: one side of the disk is being compressed and the other extended due to the fact that the angle between the axis of two adjacent vertebrae is changing. This can be observed in the pictures.The deformation is not equal on both sides. The compression on the side close to where the force is being applied during manipulation is smaller than the extension on the other side because the disk has a gel like structure inside but a hard "skin". During this procedure the disk is less compressed on one side than extended on the other. The result is a relative vacuum being created in the gel area that allows the eventual bulge to be sucked back in. It is literally a reduction or at least a partial reduction of the disk hernia.

The same with the succession of cat and dog yoga poses. The effect of this succession is very similar to the "adjustment" the chiropractors do.

This vacuum inside the disk is similar to what they obtain using traction machines, except is local and stronger. The traction machines extend all the spine and a few other articulations and then the extension effect is somewhat attenuated by a number of disks and articulations being extended in the same time.

Usually the explanation chiropractors themselves give about how it works is differrent, like alignement, subluxations and things like that. But if my explanation is the true one, it could lead to improvement of actual practices since it is obvious that the patient would benefit of rest after manipulation. If there is reduction of bulge that occurs the effect of reduction will be partially reversed by the compression created during standing and walking. With rest, the healing will be much faster and the number of manipulation decreased.

Although we cannot be sure of this either. Another phenomenon that occurs during manipulation is a hydraulic shock in all the adjacent tissues. The popping sound is there to prove it. This create a slight inflammation in all the surrounding tissues thus increasing the blood flow and accelerating the healing of the disk which is the biggest organ in the body that does not have its own blood supply and sucks its nutrients from the surrounding tissues. By walking and maintaining a higher heart rhythm and blood pressure, this effect is improved.